در ششم آپریل سال ۲۰۰۵، “ماکیکو یوشیدا” به دنبال قایقی است تا او را به مختصاتی که بزرگترین، سنگینترین و قدرتمندترین کشتی نظامی یعنی “یاماتو” در سال ۱۹۴۵ در آنجا غرق شده ببرد اما درخواستش مورد موافقت واقع نمی شود ...

جزیره ای در جنوب ژاپن. «سوسوکه» پسر بچه ای پنج ساله است که همراه مادرش در خانه ای کوچک بالای صخره ای مشرف به یک شهر کوچک بندری زندگی می کند. او با یک ماهی قرمز کوچولوی دختر به نام «پونیو» دوستی پیدا می کند که آرزو دارد انسان بشود.